嘉兴学院和嘉兴学院南湖学院区别是成立时间不同、类别不同、主要院系不同。
成立时间不同：嘉兴学院简称嘉院，位于浙江省嘉兴市，是年3月经国家教育部批准，由原浙江经济高等专科学校和嘉兴高等专科学校（湖州师范学院前身）合并组建的普通本科高校，实行“省市共建共管，以省为主”的管理体制；嘉兴南湖学院在年，嘉兴学院南湖学院正式成立，是一所经中华人民共和国教育部批准设立，嘉兴市人民*府举办、浙江省人民*府管理的公办本科层次普通高等学校，其前身为嘉兴学院南湖学院。
类别不同：嘉
兴学院属于公立大学，嘉兴学院南湖学院是一所独立大学。主要院系不同：该校建有嘉兴学院商学院、嘉兴学院数理与信息工程学院、嘉兴学院文法学院、嘉兴学院外国语学院、嘉兴学院医学院、嘉兴学院机电工程学院、嘉兴学院生物与化学工程学院、嘉兴学院材料与纺织工程学院等；嘉兴南湖学院共设有人文系、商学系、化学与纺织工程系、机电与建筑工程系、数理与信息工程系、医学系等6个二级院系，其他教学单位体育与*训教研部一个。34个本科专业，专业设置经济学、管理学、工学、文学、医学、法学等6大学科门类。
嘉兴学院南湖学院在浙江是本科招生，从年起，浙江取消三本，与二本合并。从年起，合并本科一批、二批，所以嘉兴学院南湖学院本科大学。嘉兴学院在浙江既有是第一批次招生也有第二批招生，所以严格意义上，嘉兴学院是二本大学，只有全部都在本科第一批次招生，嘉兴学院是一本大学口，如果你不是浙江考生，嘉兴学院在你所在的省份是本科一批招生的话，嘉兴学院是一本大学。